En el año de 1987 fue secretario de Estudios del Comité Ejecutivo Nacional (CEN) del PAN que presidía Luis H. Álvarez Álvarez. En 1988, a los 26 años de edad, contendió por su partido como candidato a la Asamblea de Representantes -diputado local- del Distrito Federal y ganó una curul de mayoría relativa, ésta ha sido la única vez que ha triunfado en una votación para un cargo de elección popular, ya que, hasta ese entonces, solo había sido candidato por representación proporcional (diputado de partido). Al término de su periodo como asambleísta, fue diputado federal de 1991 a 1994, tiempo durante el cual ocupó la Secretaría de la Comisión de Comercio de la Cámara de Diputados y participó en las negociaciones del Tratado de Libre Comercio de América del Norte.

• En 1993, poco antes de concluir su periodo como diputado federal, fue electo Secretario General de su Partido, cuando Carlos Castillo Peraza era el Presidente del Comite Ejecutivo Nacional (CEN). Durante ese periodo, Calderón Hinojosa, también fue representante del PAN ante el Consejo General del Instituto Federal Electoral, dejó de serlo en 1995.

• Tras concluir su periodo como legislador federal, se postuló en 1995 como candidato a gobernador de Michoacán, su estado natal, entidad donde el panismo todavía no lograba suficientes respuestas del electorado. No obtuvo la gubernatura, pero aumentó la votación a favor de su partido (25%).

• Posteriormente, fue electo Presidente del Comité Ejecutivo Nacional de su Partido, para el periodo 1996-1999.
• Fue coordinador de la fracción parlamentaria del PAN en la Cámara de Diputados durante la 58 legislatura.

• En el año 2003, se incorporó a Banobras y posteriormente al gabinete del presidente Vicente Fox como Secretario de Energía, cargo del que renunciaría poco tiempo después luego de supuestas presiones del presidente al autopostularse para la candidatura a la presidencia por su partido.

Felipe Calderón fue electo candidato a la presidencia de la República por los miembros de su partido (Partido Acción Nacional) en una serie de elecciones internas a finales del año 2005. En ellas, derrotó al ex secretario de Gobernación, Santiago Creel y al ex Gobernador de Jalisco, Alberto Cárdenas Jiménez.

Calderón tomó protesta como candidato en diciembre de 2005, y arrancó su campaña el 19 de enero de 2006.

El 2 de julio al concluir la elección, Calderón se autoproclamó vencedor conforme a los resultados que hasta ese entonces arrojaba el IFE y algunas encuestas de salida.

El 6 de julio el fallo oficial del IFE dio por ganador de la elección a Felipe Calderón. De no encontrarse irregularidades en el proceso que invaliden esta posición, el 6 de septiembre sería nombrado presidente electo. [1]

Los observadores internacionales destacaron lo transparente del proceso electoral que vivió México de una forma ejemplar, ordenada y en la cual, el ganador es Felipe Calderón [2].

Felicita el Presidente Vicente Fox a Felipe Calderón
7/7/06

Felipe Calderón Hinojosa recibió este día una llamada telefónica del Presidente Vicente Fox Quesada para felicitarlo, una vez que el Instituto Federal Electoral diera a conocer al candidato que obtuvo el mayor numero de votos de la elección del pasado dos de julio. 

El Primer Mandatario destacó la tranquilidad con que se realizaron los comicios, y se congratuló de la participación democrática y responsable de todos los ciudadanos que acudieron a las urnas.

Vicente Fox Quesada recordó que el domingo pasado la democracia se dio cita, al igual que hace seis años, en nuestra nación, y reconoció la actuación de las autoridades electorales durante el proceso.

Felicita George W. Bush a Felipe Calderón
7/7/06